リソース

当研究室で提供している研究リソースの一覧です。

GitHub リポジトリ

kfuku52/genegalleon Charting evolutionary histories across genes and species
kfuku52/csubst Analyzing combinations of codon substitution histories
kfuku52/amalgkit RNA-seq data amalgamation for a large-scale evolutionary transcriptomics
kfuku52/RADTE Divergence time estimation in the complex history of gene family evolution
kfuku52/cdskit Processing protein-coding DNA sequences in frame
kfuku52/nwkit Newick tree processing
kfuku52/averagers Estimating average temperatures from historical daily extremes
mkrg01/genome_assembly_pipeline An integrated pipeline for eukaryotic genome assembly and gene annotation
mkrg01/permucn A tool to test associations between binary trait transitions and gene-family copy-number evolution from CAFE outputs

ゲノム

NCBIの埋め込みAPIを使って各ゲノムの代表 scaffold を表示できます。

Cephalotus follicularis: BDDD01000001.1 (NCBI Genome: GCA_001972305.1 / CoGe: 29002 / Publication: Fukushima et al. (2017)

Nepenthes gracilis: BSYO01000001.1 (NCBI Genome: GCA_033239525.1 / CoGe: 61566 / Publication: Saul et al. (2023)

共同研究ネットワーク

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2007 2026
1本以上
表示する属性

著者一覧
著者 属性 共著本数 最初 最新
Kenji Fukushima 研究室主宰者 42 2007 2026
Mitsuyasu Hasebe 外部の共同研究者 9 2008 2022
Rainer Hedrich 外部の共同研究者 8 2020 2025
Victor A. Albert 外部の共同研究者 8 2017 2025
Yoshikazu Hoshi 外部の共同研究者 8 2007 2020
Matthias Freund 現在・過去の研究室メンバー 7 2020 2025
Dirk Becker 外部の共同研究者 5 2020 2025
André Marques 外部の共同研究者 4 2023 2025
David D. Pollock 外部の共同研究者 4 2017 2023
Jonathan Kirshner 外部の共同研究者 4 2025 2025
Tanya Renner 外部の共同研究者 4 2018 2025
Atsushi J. Nagano 外部の共同研究者 3 2022 2025
Gergő Pálfalvi 外部の共同研究者 3 2017 2021
Héctor Montero 現在・過去の研究室メンバー 3 2023 2025
Ines Kreuzer 外部の共同研究者 3 2020 2025
Katsuya Nagano 外部の共同研究者 3 2007 2011
Michaela Richter 外部の共同研究者 3 2023 2025
Shuji Shigenobu 外部の共同研究者 3 2017 2022
Takanori Wakatake 現在・過去の研究室メンバー 3 2022 2026
Tomoko F. Shibata 外部の共同研究者 3 2017 2022
Charlotte Lindqvist 外部の共同研究者 2 2023 2025
Chunfang Zheng 外部の共同研究者 2 2017 2025
David Sankoff 外部の共同研究者 2 2017 2025
Enrique Ibarra-Laclette 外部の共同研究者 2 2018 2025
Franziska Saul 現在・過去の研究室メンバー 2 2020 2023
Gerd Vogg 外部の共同研究者 2 2023 2025
Gerhard Bringmann 外部の共同研究者 2 2023 2025
Jörg Schultz 外部の共同研究者 2 2020 2021
Kadeem J. Gilbert 外部の共同研究者 2 2022 2023
Ken Shirasu 外部の共同研究者 2 2023 2025
Kenichi Tsuda 外部の共同研究者 2 2021 2025
Kenji Suetsugu 外部の共同研究者 2 2023 2025
Kimberly M. Farr 外部の共同研究者 2 2017 2018
Laura Ávila Robledillo 外部の共同研究者 2 2025 2025
Luis Herrera-Estrella 外部の共同研究者 2 2018 2025
Masuko Kobori 外部の共同研究者 2 2008 2009
Mathias Scharmann 外部の共同研究者 2 2023 2025
Sachiko Masuda 外部の共同研究者 2 2023 2025
Saeko Masumoto 外部の共同研究者 2 2008 2009
Seisuke Kimura 外部の共同研究者 2 2014 2023

論文ネットワーク

背景をドラッグして移動、ホイールで拡大縮小できます。
2007 2026
1人以上

論文一覧
論文 接続数 接続スコア
Contrasting centromere structures in carnivorous sundews uncover a dynamic evolutionary trajectory shaped by polyploidy and chromosomal remodeling 2025 13 51
Genomes of the Venus flytrap and close relatives unveil the roots of plant carnivory 2020 21 44
Subgenome dominance shapes novel gene evolution in the decaploid pitcher plant Nepenthes gracilis 2023 15 44
Genome of the pitcher plant Cephalotus reveals genetic changes associated with carnivory 2017 22 36
Impaired trap closure in the counting-deficient Venus flytrap mutant DYSCALCULIA is caused by cell wall biomechanics 2025 12 33
The digestive systems of carnivorous plants 2022 13 24
Carnivorous plant genomes 2018 15 23
Genome evolution and convergent innovation in the carnivorous plant Sarracenia purpurea 2025 9 19
Calcium dynamics during trap closure visualized in transgenic Venus flytrap 2020 14 16
Genome sequence of 12 Vigna species as a knowledge base of stress tolerance and resistance 2022 12 16
Tandem repeat rDNA sequences derived from parents were stably maintained in hexaploids of Drosera spathulata complex (Droseraceae) 2008 13 15
Complexity and innovation in carnivorous plant genomes 2025 7 15
How to grow a tree: Plant voltage-dependent cation channels in the spotlight of evolution 2021 7 12
A discordance of seasonally covarying cues uncovers misregulated phenotypes in the heterophyllous pitcher plant Cephalotus follicularis 2021 8 10
Contrasting patterns of the 5S and 45S rDNA evolutions in the Byblis liniflora complex (Byblidaceae) 2011 7 9
Drosera rotundifolia and Drosera tokaiensis suppress the activation of HMC-1 human mast cells 2009 7 9
Bitter gourd suppresses lipopolysaccharide-induced inflammatory responses 2008 7 9
Somatic chromosome differentiation in three species of the Byblis liniflora complex (Byblidaceae) 2008 7 9
A comparative study of karyotypes in two species of Byblis (Byblidaceae) 2007 7 9
Oriented cell division shapes carnivorous pitcher leaves of Sarracenia purpurea 2015 8 8
Adaxial–abaxial polarity: The developmental basis of leaf shape diversity 2014 8 8
Convergent losses of arbuscular mycorrhizal symbiosis in carnivorous plants 2025 7 8
On the origin of carnivory: Molecular physiology and evolution of plants on an animal diet 2021 7 7
Construction costs and tradeoffs in carnivorous pitcher plant leaves: towards a pitcher leaf economic spectrum 2025 3 4
Markov katana: A novel method for Bayesian resampling of parameter space applied to phylogenetic trees 2018 3 4
Detecting macroevolutionary genotype–phenotype associations using error-corrected rates of protein convergence 2023 3 3
Amalgamated cross-species transcriptomes reveal organ-specific propensity in gene expression evolution 2020 3 3
Transcriptomic heterochrony and completely cleistogamous flower development in the mycoheterotrophic orchid Gastrodia 2023 2 3
Transcriptomic prey-capture responses in convergently evolved carnivorous pitcher plants 2026 2 2
Convergent acquisition of disulfide-forming enzymes in malodorous flowers 2025 2 2
Molecular basis behind the isoprene emission diversity in Fagaceae 2025 2 2
Non-prey biotic interactions in carnivorous plants 2023 2 2
Genomic signature and evolutionary history of completely cleistogamous lineages in the non-photosynthetic orchid Gastrodia 2025 1 2
Emergence of isochorismate-based salicylic acid biosynthesis within Brassicales 2025 1 1
Gene expression evolution in pattern-triggered immunity within Arabidopsis thaliana and across Brassicaceae species 2021 1 1
Molecular phylogeny determined using chloroplast DNA inferred a new phylogenetic relationship of Rorippa aquatica (Eaton) EJ Palmer \& Steyermark (Brassicaceae)—lake cress 2014 1 1
Australian pitcher plant (Cephalotus follicularis) 2026 0 0
Decoding plant cell heterogeneity and dynamics across responses, development, to evolution with single-cell technologies 2026 0 0
Genomic cradle for thousands 2026 0 0
Convergent emergence of glucomannan β-galactosyltransferase activity in asterids and rosids 2024 0 0
Carnivorous plants: Unlocking the secrets of peristome geometry in pitcher plants 2023 0 0
Assembly and annotation of a draft genome of the medicinal plant Polygonum cuspidatum 2019 0 0

研究対象生物の属名カウント

対象論文数 42
抽出された属数 18
属ごとの最大論文数 7

各属について、論文タイトルまたはアブストラクトに出現した論文数を数えています。各属から Wikipedia、NCBI Taxonomy、GBIF に移動できます。

属名ごとの出現論文数

抽出された属名
属名 論文数 最初 最新 Wikipedia NCBI Taxonomy GBIF
Cephalotus 7 2017 2026 Wikipedia NCBI GBIF
Drosera 5 2008 2025 Wikipedia NCBI GBIF
Dionaea 5 2020 2025 Wikipedia NCBI GBIF
Nepenthes 5 2023 2026 Wikipedia NCBI GBIF
Arabidopsis 4 2020 2025 Wikipedia NCBI GBIF
Byblis 3 2007 2011 Wikipedia NCBI GBIF
Utricularia 3 2018 2025 Wikipedia NCBI GBIF
Sarracenia 2 2015 2025 Wikipedia NCBI GBIF
Polygonum 1 2019 2019 Wikipedia NCBI GBIF
Rorippa 1 2014 2014 Wikipedia NCBI GBIF
Quercus 1 2025 2025 Wikipedia NCBI GBIF
Aldrovanda 1 2020 2020 Wikipedia NCBI GBIF
Brocchinia 1 2025 2025 Wikipedia NCBI GBIF
Capparis 1 2025 2025 Wikipedia NCBI GBIF
Carica 1 2025 2025 Wikipedia NCBI GBIF
Momordica 1 2008 2008 Wikipedia NCBI GBIF
Roridula 1 2025 2025 Wikipedia NCBI GBIF
Solanum 1 2024 2024 Wikipedia NCBI GBIF

内部リソース

kflab: 研究室のタスク管理のためのプライベートリポジトリです。ここでは、試薬管理から実験計画の議論、そして研究の進捗報告まで、メンバー間で様々な調整が行われます。新メンバーはGitHubアカウントを作成して、福島に招待を依頼してください。